Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1QTNF1Q9BXJ1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C1QTNF1Q9BXJ1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms