Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYA6

CKAP2L, Cytoskeleton-associated protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2LQ8IYA6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CKAP2LQ8IYA6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CKAP2LQ8IYA6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms