Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NPAS3Q8IXF0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms