Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PPARGC1BQ86YN6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PPARGC1BQ86YN6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PPARGC1BQ86YN6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms