Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
WASHC2DQ5SRD0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
WASHC2DQ5SRD0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms