Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SOHLH1Q5JUK2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SOHLH1Q5JUK2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms