Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC18A3Q16572 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC18A3Q16572 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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