Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PTPRKQ15262 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
PTPRKQ15262 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PTPRKQ15262 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
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