Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPIRE1Q08AE8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPIRE1Q08AE8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms