Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RUNX1Q01196 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RUNX1Q01196 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms