Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KPNA2P52292 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KPNA2P52292 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms