Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 EBP2YKL172W 1284 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 MTD1YKR080W 963 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YLR311CYLR311C 348 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YMR178WYMR178W 825 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 HUB1YNR032C-A 222 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 HNT3YOR258W 654 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RPL19AYBR084C-A 570 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 AIP1YMR092C 1848 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 ALG8YOR067C 1734 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 MIG1YGL035C 1515 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SLA1YBL007C 3735 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 MCM7YBR202W 2538 nt3.69□□□□□ -1.82
SEC28P40509 BAR1YIL015W 1764 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 TMA108YIL137C 2841 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 MEK1YOR351C 1494 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YDR089WYDR089W 2610 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 FRQ1YDR373W 573 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 CNN1YFR046C 1086 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 KXD1YGL079W 657 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 IMP3YHR148W 552 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 LAC1YKL008C 1257 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 ECM16YMR128W 3804 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 ASI2YNL159C 870 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 IZH2YOL002C 954 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 PNG1YPL096W 1092 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YPR078CYPR078C 1119 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 CDC45YLR103C 1953 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 TOP1YOL006C 2310 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SWI1YPL016W 3945 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 SSM4YIL030C 3960 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 PWP2YCR057C 2772 nt3.68□□□□□ -1.82
SEC28P40509 FKH2YNL068C 2589 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 LTV1YKL143W 1392 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RPL35BYDL136W 363 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 MSW1YDR268W 1140 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 IES6YEL044W 501 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YEL074WYEL074W 339 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 PXR1YGR280C 816 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 DPH1YIL103W 1278 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 CDC8YJR057W 651 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 URA4YLR420W 1095 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 PBI1YPL272C 1554 nt3.67□□□□□ -1.82
SEC28P40509 NUF2YOL069W 1356 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 URA2YJL130C 6645 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 TRX3YCR083W 384 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 MRPL11YDL202W 750 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YGL074CYGL074C 327 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 LSM1YJL124C 519 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 PBA1YLR199C 831 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RUF20RUF20 443 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RLP7YNL002C 969 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YNL035CYNL035C 1170 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 YOR114WYOR114W 885 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 UTP6YDR449C 1323 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 BYE1YKL005C 1785 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 PEX1YKL197C 3132 nt3.66□□□□□ -1.82
SEC28P40509 DAN4YJR151C 3486 nt3.65□□□□□ -1.82
SEC28P40509 KAP95YLR347C 2586 nt3.65□□□□□ -1.82
SEC28P40509 RPN4YDL020C 1596 nt3.65□□□□□ -1.82
SEC28P40509 CHK1YBR274W 1584 nt3.65□□□□□ -1.82
SEC28P40509 ISC10YER180C 804 nt3.65□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MAK16YAL025C 921 nt3.65□□□□□ -1.83
SEC28P40509 USB1YLR132C 873 nt3.65□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YPL162CYPL162C 822 nt3.65□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RPS9BYBR189W 588 nt3.65□□□□□ -1.83
SEC28P40509 FYV5YCL058C 459 nt3.65□□□□□ -1.83
SEC28P40509 PPZ1YML016C 2079 nt3.65□□□□□ -1.83
SEC28P40509 DIT2YDR402C 1470 nt3.65□□□□□ -1.83
SEC28P40509 FAD1YDL045C 921 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 TGL2YDR058C 981 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 IZH1YDR492W 951 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YGR126WYGR126W 693 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 TMA19YKL056C 504 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MRP8YKL142W 660 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 COX19YLL018C-A 297 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RPS10BYMR230W 318 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 IRC14YOR135C 342 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YPR077CYPR077C 372 nt3.64□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MIP6YHR015W 1980 nt3.63□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YDL199CYDL199C 2064 nt3.63□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RSM26YJR101W 801 nt3.63□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YOL166CYOL166C 339 nt3.63□□□□□ -1.83
SEC28P40509 CCM1YGR150C 2595 nt3.63□□□□□ -1.83
SEC28P40509 SKN7YHR206W 1869 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RAD5YLR032W 3510 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 DBP5YOR046C 1449 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 FRE4YNR060W 2160 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MSD1YPL104W 1977 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YJR030CYJR030C 2238 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 MIG3YER028C 1185 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 RPS0AYGR214W 759 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 PCL7YIL050W 858 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 AIR1YIL079C 1083 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 PCD1YLR151C 1023 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 INN1YNL152W 1230 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 CPR8YNR028W 927 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 SUT2YPR009W 807 nt3.62□□□□□ -1.83
SEC28P40509 SEA4YBL104C 3117 nt3.62□□□□□ -1.83
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