Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF4A3P38919 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EIF4A3P38919 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms