Protein–RNA interactions for Protein: P21771

MRPS28, 37S ribosomal protein S28, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS28	P21771	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YLR230W	YLR230W	306 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YMR147W	YMR147W	672 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RIB4	YOL143C	510 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	ANT1	YPR128C	987 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	NMD2	YHR077C	3270 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	ISW2	YOR304W	3363 nt		3	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RRN7	YJL025W	1545 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RRT13	YER066W	558 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RPL27A	YHR010W	411 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YVH1	YIR026C	1095 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	TIF34	YMR146C	1044 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	SSU72	YNL222W	621 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	LCL1	YPL056C	306 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YPR077C	YPR077C	372 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	MET16	YPR167C	786 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	UBP12	YJL197W	3765 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	MDM1	YML104C	3384 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	VPS53	YJL029C	2469 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	NSA1	YGL111W	1392 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	LRG1	YDL240W	3054 nt		2.99	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	ECM21	YBL101C	3354 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RPS21B	YJL136C	264 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	AIM26	YKL037W	357 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YAL065C	YAL065C	387 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RCE1	YMR274C	948 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	COA2	YPL189C-A	207 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YBR116C	YBR116C	528 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	PGS1	YCL004W	1566 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	DAP2	YHR028C	2457 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	XRN1	YGL173C	4587 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.98	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RNY1	YPL123C	1305 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	SPO14	YKR031C	5052 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YCR101C	YCR101C	549 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	ERJ5	YFR041C	888 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	SNL1	YIL016W	480 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	BPT1	YLL015W	4680 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	RPL22A	YLR061W	366 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	DCS1	YLR270W	1053 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	MUP3	YHL036W	1641 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	HDA2	YDR295C	2025 nt		2.97	□□□□□ -1.93
MRPS28	P21771	SDS23	YGL056C	1584 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	TMA108	YIL137C	2841 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	ECM29	YHL030W	5607 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	DOS2	YDR068W	933 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	RPB7	YDR404C	516 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	YIL047C-A	YIL047C-A	369 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	ECM4	YKR076W	1113 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	YLR402W	YLR402W	192 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	CDC40	YDR364C	1368 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	CAF130	YGR134W	3369 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	TIF4631	YGR162W	2859 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	BUD6	YLR319C	2367 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	IMH1	YLR309C	2736 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	AIM14	YGL160W	1713 nt		2.96	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	CMK1	YFR014C	1341 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	NFT1	YKR103W	3657 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	SKN7	YHR206W	1869 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	VPS27	YNR006W	1869 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	YCL075W	YCL075W	441 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	VMA8	YEL051W	771 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	MMS2	YGL087C	414 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	IZH2	YOL002C	954 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	TMA16	YOR252W	537 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	YOR385W	YOR385W	873 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	RIB5	YBR256C	717 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	ALG1	YBR110W	1350 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	UTP25	YIL091C	2166 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.95	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	KIN3	YAR018C	1308 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	GPI13	YLL031C	3054 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	RAD5	YLR032W	3510 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	LSM1	YJL124C	519 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	RFC3	YNL290W	1023 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	FBP26	YJL155C	1359 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	TOM1	YDR457W	9807 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	TDA1	YMR291W	1761 nt		2.94	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	SPB4	YFL002C	1821 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	YDR149C	YDR149C	708 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	YHR137C-A	YHR137C-A	651 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	SYS1	YJL004C	612 nt		2.93	□□□□□ -1.94
MRPS28	P21771	TTI2	YJR136C	1266 nt		2.93	□□□□□ -1.94

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