Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IGSF3O75054 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
IGSF3O75054 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGSF3O75054 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms