Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RCCD1A6NED2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCCD1A6NED2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCCD1A6NED2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms