Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PNPLA3Q9NST1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNPLA3Q9NST1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms