Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GORASP1Q9BQQ3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GORASP1Q9BQQ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GORASP1Q9BQQ3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms