Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDX27Q96GQ7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDX27Q96GQ7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms