Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ANKRD35Q8N283 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ANKRD35Q8N283 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ANKRD35Q8N283 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms