Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NPAS3Q8IXF0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS3Q8IXF0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms