Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH18Q13634 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH18Q13634 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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