Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
GRIN2AQ12879 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
GRIN2AQ12879 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms