Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARL3P36405 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ARL3P36405 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ARL3P36405 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ARL3P36405 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms