Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP6P35125 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP6P35125 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP6P35125 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP6P35125 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP6P35125 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP6P35125 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP6P35125 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP6P35125 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP6P35125 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP6P35125 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP6P35125 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP6P35125 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP6P35125 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP6P35125 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP6P35125 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP6P35125 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
USP6P35125 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP6P35125 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP6P35125 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP6P35125 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP6P35125 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP6P35125 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP6P35125 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP6P35125 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP6P35125 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP6P35125 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP6P35125 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP6P35125 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
USP6P35125 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP6P35125 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP6P35125 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP6P35125 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP6P35125 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP6P35125 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP6P35125 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP6P35125 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP6P35125 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP6P35125 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP6P35125 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP6P35125 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP6P35125 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP6P35125 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP6P35125 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP6P35125 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP6P35125 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
USP6P35125 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP6P35125 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP6P35125 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP6P35125 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP6P35125 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
USP6P35125 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms