Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNE2O96020 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCNE2O96020 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNE2O96020 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms