Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
J3KRW8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
J3KRW8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
J3KRW8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
J3KRW8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KRW8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KRW8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KRW8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KRW8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KRW8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KRW8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
J3KRW8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
J3KRW8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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