Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.68■■■■■ 4.9
RIMBP3Q9UFD9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.67■■■■■ 4.9
RIMBP3Q9UFD9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
RIMBP3Q9UFD9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC45.66■■■■■ 4.9
RIMBP3Q9UFD9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
RIMBP3Q9UFD9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
RIMBP3Q9UFD9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
RIMBP3Q9UFD9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RIMBP3Q9UFD9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
RIMBP3Q9UFD9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
RIMBP3Q9UFD9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
RIMBP3Q9UFD9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
RIMBP3Q9UFD9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
RIMBP3Q9UFD9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.55■■■■■ 4.88
RIMBP3Q9UFD9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
RIMBP3Q9UFD9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.54■■■■■ 4.88
RIMBP3Q9UFD9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
RIMBP3Q9UFD9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.52■■■■■ 4.88
RIMBP3Q9UFD9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
RIMBP3Q9UFD9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
RIMBP3Q9UFD9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
RIMBP3Q9UFD9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.48■■■■■ 4.87
RIMBP3Q9UFD9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.46■■■■■ 4.87
RIMBP3Q9UFD9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC45.45■■■■■ 4.87
RIMBP3Q9UFD9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
RIMBP3Q9UFD9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
RIMBP3Q9UFD9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
RIMBP3Q9UFD9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
RIMBP3Q9UFD9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC45.4■■■■■ 4.86
RIMBP3Q9UFD9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RIMBP3Q9UFD9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RIMBP3Q9UFD9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC45.39■■■■■ 4.86
RIMBP3Q9UFD9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.35■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
RIMBP3Q9UFD9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
RIMBP3Q9UFD9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
RIMBP3Q9UFD9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.29■■■■■ 4.84
RIMBP3Q9UFD9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
RIMBP3Q9UFD9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
RIMBP3Q9UFD9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.26■■■■■ 4.84
RIMBP3Q9UFD9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RIMBP3Q9UFD9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RIMBP3Q9UFD9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
RIMBP3Q9UFD9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RIMBP3Q9UFD9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC45.21■■■■■ 4.83
RIMBP3Q9UFD9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RIMBP3Q9UFD9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
RIMBP3Q9UFD9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
RIMBP3Q9UFD9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
RIMBP3Q9UFD9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
RIMBP3Q9UFD9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
RIMBP3Q9UFD9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
RIMBP3Q9UFD9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
RIMBP3Q9UFD9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RIMBP3Q9UFD9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
RIMBP3Q9UFD9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
RIMBP3Q9UFD9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
RIMBP3Q9UFD9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
RIMBP3Q9UFD9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
RIMBP3Q9UFD9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC44.97■■■■■ 4.79
RIMBP3Q9UFD9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
RIMBP3Q9UFD9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC44.94■■■■■ 4.79
RIMBP3Q9UFD9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.91■■■■■ 4.78
RIMBP3Q9UFD9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
RIMBP3Q9UFD9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
RIMBP3Q9UFD9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC44.86■■■■■ 4.77
RIMBP3Q9UFD9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
RIMBP3Q9UFD9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
RIMBP3Q9UFD9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
RIMBP3Q9UFD9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RIMBP3Q9UFD9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
RIMBP3Q9UFD9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RIMBP3Q9UFD9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.69■■■■■ 4.75
RIMBP3Q9UFD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
RIMBP3Q9UFD9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
RIMBP3Q9UFD9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms