Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.811e-8■■■■■ 84.4
DROSHAQ9NRR4 MIR503HG-201ENST00000414769 720 ntTSL 224.13■■□□□ 1.451e-8■■■■■ 84.4
DROSHAQ9NRR4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.051e-8■■■■■ 84.4
DROSHAQ9NRR4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.592e-10■■■■■ 83.1
DROSHAQ9NRR4 GAK-208ENST00000507124 552 ntTSL 436.47■■■■□ 3.431e-13■■■■■ 83
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.957e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-203ENST00000557930 582 ntTSL 220.79■□□□□ 0.927e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-205ENST00000560069 575 ntTSL 418.76■□□□□ 0.597e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.557e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 214.57□□□□□ -0.087e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 NIPA1-202ENST00000437912 7613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.057e-11■■■■■ 82.8
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.346e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.596e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-207ENST00000551594 900 ntTSL 328.69■■■□□ 2.186e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.96e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-205ENST00000549039 797 ntTSL 219.07■□□□□ 0.646e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 CTDSP2-206ENST00000550144 544 ntTSL 417.5■□□□□ 0.396e-9■■■■■ 82.2
DROSHAQ9NRR4 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.089e-20■■■■■ 80.7
DROSHAQ9NRR4 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.53e-24■■■■■ 80.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-207ENST00000463309 685 ntTSL 328.75■■■□□ 2.195e-7■■■■■ 80.6
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-208ENST00000464203 766 ntTSL 527.73■■■□□ 2.035e-7■■■■■ 80.6
DROSHAQ9NRR4 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 236.74■■■■□ 3.472e-7■■■■■ 80.4
DROSHAQ9NRR4 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 236.27■■■■□ 3.42e-7■■■■■ 80.4
DROSHAQ9NRR4 PTPRF-211ENST00000467464 571 ntTSL 318.66■□□□□ 0.585e-9■■■■■ 79.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 328.32■■■□□ 2.126e-7■■■■■ 79.2
DROSHAQ9NRR4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.173e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.133e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 240.1■■■■■ 4.013e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.933e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.723e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.653e-10■■■■■ 79.1
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 78.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.157e-7■■■■■ 78.3
DROSHAQ9NRR4 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.37e-7■■■■■ 78.3
DROSHAQ9NRR4 SQSTM1-210ENST00000506042 921 ntTSL 233.01■■■□□ 2.882e-10■■■■■ 78
DROSHAQ9NRR4 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 533.57■■■□□ 2.964e-7■■■■■ 77.9
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-213ENST00000602537 948 ntTSL 535.77■■■■□ 3.322e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-215ENST00000602811 1136 ntTSL 535.25■■■■□ 3.232e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-211ENST00000602305 961 ntTSL 535.25■■■■□ 3.232e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-214ENST00000602686 977 ntTSL 534.38■■■■□ 3.092e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-212ENST00000602375 1064 ntTSL 534.36■■■■□ 3.092e-9■■■■■ 77.7
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DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.112e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-202ENST00000415385 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-204ENST00000538465 925 ntTSL 57.97□□□□□ -1.132e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-205ENST00000579089 571 ntTSL 47.96□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-206ENST00000581941 813 ntTSL 33.63□□□□□ -1.832e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 MAP2K4-209ENST00000582897 482 ntTSL 51.29□□□□□ -2.22e-9■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-223ENST00000497822 542 ntTSL 230.2■■■□□ 2.436e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-210ENST00000465270 543 ntTSL 229.96■■■□□ 2.396e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-216ENST00000484428 578 ntTSL 327.1■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-219ENST00000489877 536 ntTSL 527.1■■□□□ 1.936e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-215ENST00000482932 826 ntTSL 526.09■■□□□ 1.776e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-217ENST00000486517 726 ntTSL 324.9■■□□□ 1.586e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-213ENST00000471156 764 ntTSL 520.26■□□□□ 0.836e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-204ENST00000368243 879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.266e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-214ENST00000476966 2697 ntTSL 216.42■□□□□ 0.226e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-201ENST00000310027 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-202ENST00000357975 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.11□□□□□ -0.476e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-224ENST00000497824 725 ntTSL 1 (best)6.64□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 C1orf61-205ENST00000400991 473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.576e-7■■■■■ 77.7
DROSHAQ9NRR4 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 77.4
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DROSHAQ9NRR4 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 77.3
DROSHAQ9NRR4 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 77
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DROSHAQ9NRR4 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 17e-10■■■■■ 76.2
DROSHAQ9NRR4 LEMD1-211ENST00000629624 576 ntTSL 416.09■□□□□ 0.177e-10■■■■■ 76.2
DROSHAQ9NRR4 LEMD1-209ENST00000625854 516 ntTSL 413.86□□□□□ -0.197e-10■■■■■ 76.2
DROSHAQ9NRR4 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.47e-10■■■■■ 76.2
DROSHAQ9NRR4 LRP8-208ENST00000475501 721 ntTSL 314.01□□□□□ -0.173e-11■■■■■ 75
DROSHAQ9NRR4 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.911e-10■■■■■ 74.8
DROSHAQ9NRR4 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC8□□□□□ -1.138e-35■■■■■ 74.8
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.246e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-210ENST00000482726 538 ntTSL 432.82■■■□□ 2.846e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-204ENST00000427463 582 ntTSL 332.82■■■□□ 2.846e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.316e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-203ENST00000419774 589 ntTSL 526.88■■□□□ 1.896e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-211ENST00000484141 566 ntTSL 225.93■■□□□ 1.746e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-205ENST00000430644 2621 ntTSL 223.98■■□□□ 1.436e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.946e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 PCGF3-207ENST00000440452 3609 ntTSL 216.79■□□□□ 0.286e-7■■■■■ 74.7
DROSHAQ9NRR4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.063e-9■■■■■ 74.3
DROSHAQ9NRR4 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 311.61□□□□□ -0.553e-9■■■■■ 74.3
DROSHAQ9NRR4 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 51.26□□□□□ -2.213e-9■■■■■ 74.3
DROSHAQ9NRR4 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 50.83□□□□□ -2.283e-9■■■■■ 74.3
DROSHAQ9NRR4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.264e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.414e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.364e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.354e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-210ENST00000603364 1551 ntTSL 220.93■□□□□ 0.944e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.814e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.84e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.784e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.354e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.244e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.214e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.24e-13■■■■■ 73.9
DROSHAQ9NRR4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 73.7
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8P1-203ENST00000420968 1736 ntTSL 230.99■■■□□ 2.552e-9■■■■■ 72.5
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