Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00208Q96KT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00208Q96KT6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LINC00208Q96KT6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00208Q96KT6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00208Q96KT6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms