Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC4.59□□□□□ -1.673e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-260ENST00000642078 1747 nt4.49□□□□□ -1.693e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-206ENST00000554005 450 ntTSL 54.48□□□□□ -1.693e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-228ENST00000641397 3925 nt4.27□□□□□ -1.733e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC4.22□□□□□ -1.733e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-252ENST00000641869 1076 nt4.17□□□□□ -1.743e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-230ENST00000641434 3209 nt4.17□□□□□ -1.743e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC3.91□□□□□ -1.783e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-229ENST00000641413 854 nt3.83□□□□□ -1.83e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-235ENST00000641508 4321 nt3.73□□□□□ -1.813e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-218ENST00000557718 398 ntTSL 53.72□□□□□ -1.813e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-240ENST00000641658 1731 nt3.68□□□□□ -1.823e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-211ENST00000641092 4054 nt3.65□□□□□ -1.833e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-258ENST00000642034 4132 nt3.25□□□□□ -1.893e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-255ENST00000641928 4083 nt3.15□□□□□ -1.913e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-212ENST00000641133 5109 nt3.09□□□□□ -1.913e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.07□□□□□ -1.923e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.98□□□□□ -1.933e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-232ENST00000641464 4197 nt2.94□□□□□ -1.943e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC2.94□□□□□ -1.943e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-213ENST00000556916 467 ntTSL 32.86□□□□□ -1.953e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-210ENST00000555658 648 ntTSL 32.82□□□□□ -1.963e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-248ENST00000641774 4247 nt2.66□□□□□ -1.983e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-210ENST00000641025 4261 nt2.37□□□□□ -2.033e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 FOXN3-203ENST00000553353 366 ntTSL 32.33□□□□□ -2.043e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.28□□□□□ -2.053e-8■■■■□ 26.7
SRSF9Q13242 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 213.85□□□□□ -0.192e-8■■■■□ 26.5
SRSF9Q13242 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 512.21□□□□□ -0.462e-8■■■■□ 26.5
SRSF9Q13242 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-8■■■■□ 26.5
SRSF9Q13242 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 39.25□□□□□ -0.932e-8■■■■□ 26.5
SRSF9Q13242 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 57.13□□□□□ -1.272e-8■■■■□ 26.5
SRSF9Q13242 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 26.4
SRSF9Q13242 CHN2-203ENST00000409350 539 ntTSL 48.93□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 26.4
SRSF9Q13242 CHN2-213ENST00000439384 578 ntTSL 58.11□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 26.4
SRSF9Q13242 CHN2-205ENST00000409964 547 ntTSL 46.49□□□□□ -1.372e-6■■■■□ 26.4
SRSF9Q13242 CHN2-220ENST00000474070 754 ntTSL 55.77□□□□□ -1.492e-6■■■■□ 26.4
SRSF9Q13242 CHN2-226ENST00000495789 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.542e-6■■■■□ 26.4
SRSF9Q13242 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC3.83□□□□□ -1.82e-6■■■■□ 26.4
SRSF9Q13242 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.454e-8■■■■□ 26.2
SRSF9Q13242 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.054e-8■■■■□ 26.2
SRSF9Q13242 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.554e-8■■■■□ 26.2
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SRSF9Q13242 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.74e-8■■■■□ 26.2
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SRSF9Q13242 SLC22A23-207ENST00000467177 1221 ntTSL 1 (best)8.87□□□□□ -0.994e-8■■■■□ 26.2
SRSF9Q13242 SLC22A23-206ENST00000467144 542 ntTSL 48.32□□□□□ -1.084e-8■■■■□ 26.2
SRSF9Q13242 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 47.29□□□□□ -1.244e-8■■■■□ 26.2
SRSF9Q13242 FANCA-221ENST00000566889 2201 ntTSL 1 (best)19.31■□□□□ 0.685e-8■■■■□ 26
SRSF9Q13242 MUM1-208ENST00000590695 2290 ntTSL 519.18■□□□□ 0.665e-8■■■■□ 26
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SRSF9Q13242 MYO19-218ENST00000617189 1990 ntTSL 211.53□□□□□ -0.565e-8■■■■□ 26
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SRSF9Q13242 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.135e-8■■■■□ 26
SRSF9Q13242 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 37.91□□□□□ -1.145e-8■■■■□ 26
SRSF9Q13242 FANCA-218ENST00000565582 812 ntTSL 37.35□□□□□ -1.235e-8■■■■□ 26
SRSF9Q13242 MUM1-206ENST00000588810 867 ntTSL 57□□□□□ -1.295e-8■■■■□ 26
SRSF9Q13242 FANCA-225ENST00000567621 618 ntTSL 36.1□□□□□ -1.435e-8■■■■□ 26
SRSF9Q13242 TRAPPC12-214ENST00000462983 543 ntTSL 45.68□□□□□ -1.55e-8■■■■□ 26
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SRSF9Q13242 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 211.55□□□□□ -0.562e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 EML4-205ENST00000409040 962 ntTSL 1 (best)10.5□□□□□ -0.732e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 METAP2-211ENST00000553151 564 ntTSL 510.19□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 FILIP1L-207ENST00000476723 567 ntTSL 410.16□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 ATP11A-210ENST00000471555 5786 ntTSL 1 (best)9.97□□□□□ -0.812e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 TF-201ENST00000402696 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.92e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.92e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -12e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.082e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 FILIP1L-210ENST00000495625 2898 ntTSL 1 (best)8.27□□□□□ -1.092e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 ATP11A-208ENST00000459908 4516 ntTSL 27.84□□□□□ -1.162e-7■■■■□ 25.8
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SRSF9Q13242 ATP11A-213ENST00000489577 383 ntTSL 57.25□□□□□ -1.252e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.282e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 ATP11A-204ENST00000418678 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.462e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 METAP2-206ENST00000549136 388 ntTSL 25.55□□□□□ -1.522e-7■■■■□ 25.8
SRSF9Q13242 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.622e-7■■■■□ 25.8
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