Protein–RNA interactions for Protein: Q02575

NHLH1, Helix-loop-helix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH1Q02575 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NHLH1Q02575 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHLH1Q02575 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHLH1Q02575 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NHLH1Q02575 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NHLH1Q02575 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NHLH1Q02575 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NHLH1Q02575 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NHLH1Q02575 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NHLH1Q02575 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NHLH1Q02575 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NHLH1Q02575 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NHLH1Q02575 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NHLH1Q02575 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NHLH1Q02575 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NHLH1Q02575 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NHLH1Q02575 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NHLH1Q02575 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NHLH1Q02575 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NHLH1Q02575 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NHLH1Q02575 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NHLH1Q02575 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NHLH1Q02575 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHLH1Q02575 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NHLH1Q02575 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NHLH1Q02575 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NHLH1Q02575 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHLH1Q02575 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NHLH1Q02575 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHLH1Q02575 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NHLH1Q02575 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NHLH1Q02575 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHLH1Q02575 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NHLH1Q02575 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NHLH1Q02575 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NHLH1Q02575 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NHLH1Q02575 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NHLH1Q02575 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NHLH1Q02575 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NHLH1Q02575 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NHLH1Q02575 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NHLH1Q02575 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NHLH1Q02575 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NHLH1Q02575 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NHLH1Q02575 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NHLH1Q02575 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NHLH1Q02575 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NHLH1Q02575 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NHLH1Q02575 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms