Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLIC3O95833 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLIC3O95833 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CLIC3O95833 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLIC3O95833 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC3O95833 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLIC3O95833 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC3O95833 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLIC3O95833 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLIC3O95833 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLIC3O95833 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLIC3O95833 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLIC3O95833 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CLIC3O95833 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC3O95833 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLIC3O95833 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLIC3O95833 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CLIC3O95833 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLIC3O95833 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLIC3O95833 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC3O95833 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC3O95833 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIC3O95833 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms