Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB5Q9Y5E4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB5Q9Y5E4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms