Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN11AQ9UI33 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCN11AQ9UI33 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCN11AQ9UI33 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms