Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EBF4Q9BQW3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
EBF4Q9BQW3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms