Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEMA3CQ99985 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEMA3CQ99985 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms