Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD1Q96RS6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD1Q96RS6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms