Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC62Q6P9F0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC62Q6P9F0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC62Q6P9F0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms