Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD20A3Q5VUR7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD20A3Q5VUR7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms