Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WASHC2DQ5SRD0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms