Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SPTAN1Q13813 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTAN1Q13813 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTAN1Q13813 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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