Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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TRAF3Q13114 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAF3Q13114 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAF3Q13114 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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