Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NFIAQ12857 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIAQ12857 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIAQ12857 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
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