Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SREBF2Q12772 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SREBF2Q12772 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SREBF2Q12772 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
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