Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE1BQ01064 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE1BQ01064 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms