Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF4A3P38919 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF4A3P38919 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms