Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTNP21246 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTNP21246 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTNP21246 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTNP21246 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTNP21246 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTNP21246 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTNP21246 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms