Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF888P0CJ79 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF888P0CJ79 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms