Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN7O94888 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN7O94888 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms